Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC3Q96F86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC3Q96F86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC3Q96F86 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EDC3Q96F86 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EDC3Q96F86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EDC3Q96F86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
EDC3Q96F86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EDC3Q96F86 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms