Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS33AQ96AX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS33AQ96AX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS33AQ96AX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS33AQ96AX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS33AQ96AX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS33AQ96AX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms