Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL26A1Q96A83 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL26A1Q96A83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL26A1Q96A83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL26A1Q96A83 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL26A1Q96A83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL26A1Q96A83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms