Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARVELD3Q96A59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MARVELD3Q96A59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARVELD3Q96A59 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARVELD3Q96A59 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MARVELD3Q96A59 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARVELD3Q96A59 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARVELD3Q96A59 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms