Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HGDQ93099 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HGDQ93099 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HGDQ93099 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HGDQ93099 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HGDQ93099 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HGDQ93099 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HGDQ93099 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HGDQ93099 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HGDQ93099 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HGDQ93099 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HGDQ93099 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HGDQ93099 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HGDQ93099 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HGDQ93099 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HGDQ93099 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HGDQ93099 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HGDQ93099 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HGDQ93099 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HGDQ93099 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HGDQ93099 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HGDQ93099 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HGDQ93099 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HGDQ93099 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HGDQ93099 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HGDQ93099 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HGDQ93099 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HGDQ93099 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HGDQ93099 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HGDQ93099 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HGDQ93099 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HGDQ93099 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HGDQ93099 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HGDQ93099 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HGDQ93099 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HGDQ93099 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HGDQ93099 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HGDQ93099 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HGDQ93099 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HGDQ93099 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HGDQ93099 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HGDQ93099 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HGDQ93099 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HGDQ93099 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HGDQ93099 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HGDQ93099 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HGDQ93099 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HGDQ93099 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HGDQ93099 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HGDQ93099 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HGDQ93099 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HGDQ93099 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HGDQ93099 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HGDQ93099 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HGDQ93099 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HGDQ93099 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HGDQ93099 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HGDQ93099 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HGDQ93099 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HGDQ93099 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HGDQ93099 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HGDQ93099 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HGDQ93099 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HGDQ93099 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HGDQ93099 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HGDQ93099 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HGDQ93099 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HGDQ93099 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HGDQ93099 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HGDQ93099 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HGDQ93099 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HGDQ93099 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HGDQ93099 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HGDQ93099 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HGDQ93099 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HGDQ93099 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HGDQ93099 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HGDQ93099 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HGDQ93099 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HGDQ93099 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HGDQ93099 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HGDQ93099 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HGDQ93099 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms