Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TNRQ92752 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
TNRQ92752 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TNRQ92752 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNRQ92752 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TNRQ92752 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNRQ92752 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TNRQ92752 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNRQ92752 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TNRQ92752 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TNRQ92752 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TNRQ92752 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TNRQ92752 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TNRQ92752 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNRQ92752 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TNRQ92752 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNRQ92752 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TNRQ92752 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TNRQ92752 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TNRQ92752 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
TNRQ92752 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNRQ92752 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNRQ92752 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TNRQ92752 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNRQ92752 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNRQ92752 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TNRQ92752 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TNRQ92752 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TNRQ92752 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TNRQ92752 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNRQ92752 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNRQ92752 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNRQ92752 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TNRQ92752 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TNRQ92752 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TNRQ92752 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNRQ92752 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TNRQ92752 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNRQ92752 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNRQ92752 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNRQ92752 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TNRQ92752 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNRQ92752 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TNRQ92752 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TNRQ92752 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
TNRQ92752 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
TNRQ92752 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNRQ92752 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNRQ92752 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNRQ92752 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TNRQ92752 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNRQ92752 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TNRQ92752 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNRQ92752 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNRQ92752 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNRQ92752 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TNRQ92752 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TNRQ92752 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNRQ92752 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNRQ92752 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNRQ92752 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TNRQ92752 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNRQ92752 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNRQ92752 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TNRQ92752 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TNRQ92752 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TNRQ92752 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TNRQ92752 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
TNRQ92752 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNRQ92752 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNRQ92752 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNRQ92752 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNRQ92752 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TNRQ92752 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TNRQ92752 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TNRQ92752 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNRQ92752 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNRQ92752 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TNRQ92752 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNRQ92752 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNRQ92752 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNRQ92752 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
TNRQ92752 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNRQ92752 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNRQ92752 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNRQ92752 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNRQ92752 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNRQ92752 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNRQ92752 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TNRQ92752 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms