Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC8Q8TC99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC8Q8TC99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC8Q8TC99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC8Q8TC99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FNDC8Q8TC99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC8Q8TC99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC8Q8TC99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms