Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM1Q8TC05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM1Q8TC05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MDM1Q8TC05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM1Q8TC05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MDM1Q8TC05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MDM1Q8TC05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM1Q8TC05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM1Q8TC05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms