Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAF1Q8N7H5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAF1Q8N7H5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAF1Q8N7H5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAF1Q8N7H5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms