Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPICQ8N5J4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPICQ8N5J4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPICQ8N5J4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPICQ8N5J4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPICQ8N5J4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPICQ8N5J4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPICQ8N5J4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms