Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPICQ8N5J4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPICQ8N5J4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPICQ8N5J4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPICQ8N5J4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICQ8N5J4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICQ8N5J4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICQ8N5J4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICQ8N5J4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPICQ8N5J4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICQ8N5J4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICQ8N5J4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPICQ8N5J4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SPICQ8N5J4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPICQ8N5J4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPICQ8N5J4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPICQ8N5J4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPICQ8N5J4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPICQ8N5J4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPICQ8N5J4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPICQ8N5J4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPICQ8N5J4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPICQ8N5J4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPICQ8N5J4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPICQ8N5J4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPICQ8N5J4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPICQ8N5J4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPICQ8N5J4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPICQ8N5J4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPICQ8N5J4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPICQ8N5J4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPICQ8N5J4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPICQ8N5J4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICQ8N5J4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICQ8N5J4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICQ8N5J4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICQ8N5J4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICQ8N5J4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICQ8N5J4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICQ8N5J4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICQ8N5J4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICQ8N5J4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICQ8N5J4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICQ8N5J4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICQ8N5J4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPICQ8N5J4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICQ8N5J4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPICQ8N5J4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPICQ8N5J4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPICQ8N5J4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPICQ8N5J4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPICQ8N5J4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPICQ8N5J4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPICQ8N5J4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPICQ8N5J4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPICQ8N5J4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPICQ8N5J4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPICQ8N5J4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICQ8N5J4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPICQ8N5J4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPICQ8N5J4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPICQ8N5J4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPICQ8N5J4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPICQ8N5J4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPICQ8N5J4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPICQ8N5J4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPICQ8N5J4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPICQ8N5J4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPICQ8N5J4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPICQ8N5J4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPICQ8N5J4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPICQ8N5J4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPICQ8N5J4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPICQ8N5J4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPICQ8N5J4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPICQ8N5J4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPICQ8N5J4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPICQ8N5J4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPICQ8N5J4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPICQ8N5J4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPICQ8N5J4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPICQ8N5J4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPICQ8N5J4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPICQ8N5J4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms