Protein–RNA interactions for Protein: Q8N434

SVOPL, Putative transporter SVOPL, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPLQ8N434 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SVOPLQ8N434 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SVOPLQ8N434 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SVOPLQ8N434 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SVOPLQ8N434 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SVOPLQ8N434 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SVOPLQ8N434 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms