Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPALPP1Q8IXQ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPALPP1Q8IXQ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPALPP1Q8IXQ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPALPP1Q8IXQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPALPP1Q8IXQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPALPP1Q8IXQ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms