Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CD302Q8IX05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD302Q8IX05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD302Q8IX05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD302Q8IX05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CD302Q8IX05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD302Q8IX05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms