Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM48Q8IWZ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM48Q8IWZ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM48Q8IWZ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM48Q8IWZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM48Q8IWZ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms