Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC117Q8IWD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC117Q8IWD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC117Q8IWD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC117Q8IWD4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC117Q8IWD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms