Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRAG1Q86YV5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRAG1Q86YV5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRAG1Q86YV5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PRAG1Q86YV5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PRAG1Q86YV5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRAG1Q86YV5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRAG1Q86YV5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PRAG1Q86YV5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRAG1Q86YV5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRAG1Q86YV5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms