Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TXNDC2Q86VQ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TXNDC2Q86VQ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TXNDC2Q86VQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TXNDC2Q86VQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TXNDC2Q86VQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TXNDC2Q86VQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TXNDC2Q86VQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TXNDC2Q86VQ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms