Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
N4BP2Q86UW6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
N4BP2Q86UW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
N4BP2Q86UW6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
N4BP2Q86UW6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
N4BP2Q86UW6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
N4BP2Q86UW6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
N4BP2Q86UW6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
N4BP2Q86UW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
N4BP2Q86UW6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
N4BP2Q86UW6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
N4BP2Q86UW6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
N4BP2Q86UW6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
N4BP2Q86UW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms