Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSX6Q7RTT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSX6Q7RTT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX6Q7RTT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX6Q7RTT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX6Q7RTT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX6Q7RTT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms