Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAP2EQ6VUC0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAP2EQ6VUC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAP2EQ6VUC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFAP2EQ6VUC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms