Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X8

PGBD2, PiggyBac transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD2Q6P3X8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD2Q6P3X8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD2Q6P3X8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD2Q6P3X8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD2Q6P3X8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGBD2Q6P3X8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD2Q6P3X8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms