Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPRIN2Q6IMN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPRIN2Q6IMN6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPRIN2Q6IMN6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPRIN2Q6IMN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPRIN2Q6IMN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms