Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND4CQ5VZ89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND4CQ5VZ89 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND4CQ5VZ89 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND4CQ5VZ89 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND4CQ5VZ89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND4CQ5VZ89 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms