Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FOCADQ5VW36 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOCADQ5VW36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOCADQ5VW36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FOCADQ5VW36 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOCADQ5VW36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOCADQ5VW36 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOCADQ5VW36 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOCADQ5VW36 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms