Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
OBSCNQ5VST9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms