Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
L1TD1Q5T7N2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
L1TD1Q5T7N2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
L1TD1Q5T7N2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
L1TD1Q5T7N2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
L1TD1Q5T7N2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
L1TD1Q5T7N2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
L1TD1Q5T7N2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
L1TD1Q5T7N2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms