Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LACTB2Q53H82 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LACTB2Q53H82 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LACTB2Q53H82 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LACTB2Q53H82 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LACTB2Q53H82 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LACTB2Q53H82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LACTB2Q53H82 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms