Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4EQ3MJ16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G4EQ3MJ16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4EQ3MJ16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G4EQ3MJ16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLA2G4EQ3MJ16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms