Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms