Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
DDB1Q16531 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
DDB1Q16531 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DDB1Q16531 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
DDB1Q16531 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DDB1Q16531 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
DDB1Q16531 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
DDB1Q16531 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DDB1Q16531 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
DDB1Q16531 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
DDB1Q16531 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
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