Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms