Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD5Q16401 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD5Q16401 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD5Q16401 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD5Q16401 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMD5Q16401 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMD5Q16401 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMD5Q16401 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD5Q16401 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMD5Q16401 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSMD5Q16401 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD5Q16401 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD5Q16401 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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