Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
LAMA4Q16363 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LAMA4Q16363 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAMA4Q16363 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMA4Q16363 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LAMA4Q16363 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LAMA4Q16363 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMA4Q16363 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
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