Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN1Q15811 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ITSN1Q15811 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ITSN1Q15811 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITSN1Q15811 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ITSN1Q15811 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ITSN1Q15811 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
ITSN1Q15811 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ITSN1Q15811 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITSN1Q15811 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms