Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP1Q15431 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP1Q15431 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP1Q15431 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYCP1Q15431 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYCP1Q15431 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP1Q15431 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP1Q15431 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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