Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR3Q13615 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTMR3Q13615 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR3Q13615 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR3Q13615 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR3Q13615 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR3Q13615 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR3Q13615 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR3Q13615 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
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