Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP140Q13342 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP140Q13342 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP140Q13342 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP140Q13342 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP140Q13342 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP140Q13342 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP140Q13342 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP140Q13342 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP140Q13342 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP140Q13342 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP140Q13342 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP140Q13342 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP140Q13342 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SP140Q13342 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SP140Q13342 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP140Q13342 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SP140Q13342 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SP140Q13342 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SP140Q13342 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP140Q13342 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP140Q13342 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP140Q13342 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SP140Q13342 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP140Q13342 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP140Q13342 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP140Q13342 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SP140Q13342 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SP140Q13342 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP140Q13342 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP140Q13342 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP140Q13342 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP140Q13342 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP140Q13342 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP140Q13342 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP140Q13342 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP140Q13342 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP140Q13342 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP140Q13342 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP140Q13342 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP140Q13342 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP140Q13342 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SP140Q13342 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140Q13342 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140Q13342 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140Q13342 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140Q13342 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140Q13342 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140Q13342 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140Q13342 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP140Q13342 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP140Q13342 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP140Q13342 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP140Q13342 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP140Q13342 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP140Q13342 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP140Q13342 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP140Q13342 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP140Q13342 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP140Q13342 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP140Q13342 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP140Q13342 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP140Q13342 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP140Q13342 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SP140Q13342 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SP140Q13342 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP140Q13342 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP140Q13342 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP140Q13342 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP140Q13342 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP140Q13342 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP140Q13342 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP140Q13342 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP140Q13342 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SP140Q13342 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP140Q13342 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140Q13342 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140Q13342 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140Q13342 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140Q13342 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140Q13342 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP140Q13342 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP140Q13342 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP140Q13342 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP140Q13342 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP140Q13342 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP140Q13342 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP140Q13342 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP140Q13342 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP140Q13342 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP140Q13342 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP140Q13342 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP140Q13342 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP140Q13342 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP140Q13342 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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