Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPP2Q13103 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SPP2Q13103 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SPP2Q13103 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SPP2Q13103 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SPP2Q13103 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SPP2Q13103 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SPP2Q13103 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPP2Q13103 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms