Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
ABCC8Q09428 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC46.52■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
ABCC8Q09428 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
ABCC8Q09428 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
ABCC8Q09428 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCC8Q09428 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
ABCC8Q09428 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC8Q09428 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC8Q09428 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
ABCC8Q09428 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ABCC8Q09428 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
ABCC8Q09428 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCC8Q09428 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCC8Q09428 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC46.12■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ABCC8Q09428 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
ABCC8Q09428 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC46■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
ABCC8Q09428 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms