Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAP1Q03518 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAP1Q03518 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TAP1Q03518 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAP1Q03518 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAP1Q03518 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAP1Q03518 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms