Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFBR3Q03167 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR3Q03167 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR3Q03167 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR3Q03167 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms