Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKPQ01813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKPQ01813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKPQ01813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFKPQ01813 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKPQ01813 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms