Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
UBXN2AP68543 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
UBXN2AP68543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBXN2AP68543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBXN2AP68543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBXN2AP68543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBXN2AP68543 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBXN2AP68543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms