Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKP1P63208 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKP1P63208 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKP1P63208 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKP1P63208 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKP1P63208 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKP1P63208 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKP1P63208 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKP1P63208 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKP1P63208 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKP1P63208 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKP1P63208 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKP1P63208 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKP1P63208 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKP1P63208 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKP1P63208 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKP1P63208 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKP1P63208 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKP1P63208 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKP1P63208 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKP1P63208 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SKP1P63208 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKP1P63208 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKP1P63208 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SKP1P63208 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKP1P63208 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKP1P63208 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKP1P63208 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKP1P63208 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKP1P63208 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKP1P63208 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKP1P63208 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKP1P63208 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKP1P63208 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKP1P63208 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKP1P63208 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKP1P63208 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKP1P63208 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKP1P63208 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKP1P63208 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKP1P63208 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKP1P63208 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKP1P63208 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKP1P63208 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKP1P63208 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKP1P63208 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKP1P63208 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKP1P63208 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKP1P63208 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKP1P63208 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKP1P63208 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKP1P63208 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKP1P63208 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SKP1P63208 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKP1P63208 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKP1P63208 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKP1P63208 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKP1P63208 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKP1P63208 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SKP1P63208 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKP1P63208 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKP1P63208 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKP1P63208 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKP1P63208 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKP1P63208 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKP1P63208 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKP1P63208 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKP1P63208 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKP1P63208 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKP1P63208 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKP1P63208 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKP1P63208 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKP1P63208 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKP1P63208 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKP1P63208 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKP1P63208 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKP1P63208 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKP1P63208 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SKP1P63208 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKP1P63208 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKP1P63208 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKP1P63208 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKP1P63208 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKP1P63208 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKP1P63208 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKP1P63208 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKP1P63208 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKP1P63208 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKP1P63208 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms