Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SUMO1P63165 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUMO1P63165 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUMO1P63165 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUMO1P63165 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUMO1P63165 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms