Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01547P58512 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01547P58512 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01547P58512 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01547P58512 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms