Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YARSP54577 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YARSP54577 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YARSP54577 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YARSP54577 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YARSP54577 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YARSP54577 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YARSP54577 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
YARSP54577 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YARSP54577 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YARSP54577 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YARSP54577 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YARSP54577 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YARSP54577 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YARSP54577 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YARSP54577 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YARSP54577 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YARSP54577 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YARSP54577 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YARSP54577 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YARSP54577 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YARSP54577 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YARSP54577 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YARSP54577 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YARSP54577 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YARSP54577 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YARSP54577 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YARSP54577 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YARSP54577 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YARSP54577 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YARSP54577 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
YARSP54577 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YARSP54577 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YARSP54577 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YARSP54577 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YARSP54577 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YARSP54577 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YARSP54577 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YARSP54577 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YARSP54577 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YARSP54577 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YARSP54577 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YARSP54577 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YARSP54577 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YARSP54577 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YARSP54577 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YARSP54577 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YARSP54577 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YARSP54577 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YARSP54577 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YARSP54577 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YARSP54577 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YARSP54577 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YARSP54577 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YARSP54577 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YARSP54577 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YARSP54577 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
YARSP54577 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YARSP54577 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YARSP54577 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YARSP54577 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YARSP54577 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YARSP54577 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YARSP54577 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YARSP54577 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YARSP54577 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YARSP54577 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
YARSP54577 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YARSP54577 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YARSP54577 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YARSP54577 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YARSP54577 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YARSP54577 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YARSP54577 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YARSP54577 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YARSP54577 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YARSP54577 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YARSP54577 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YARSP54577 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YARSP54577 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YARSP54577 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YARSP54577 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YARSP54577 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YARSP54577 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
YARSP54577 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YARSP54577 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YARSP54577 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YARSP54577 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YARSP54577 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms