Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFIP1P53367 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP1P53367 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP1P53367 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFIP1P53367 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP1P53367 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP1P53367 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms