Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THOP1P52888 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THOP1P52888 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THOP1P52888 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THOP1P52888 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THOP1P52888 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THOP1P52888 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THOP1P52888 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THOP1P52888 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THOP1P52888 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THOP1P52888 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
THOP1P52888 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THOP1P52888 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THOP1P52888 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THOP1P52888 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THOP1P52888 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THOP1P52888 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THOP1P52888 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
THOP1P52888 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THOP1P52888 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THOP1P52888 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THOP1P52888 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THOP1P52888 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THOP1P52888 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THOP1P52888 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THOP1P52888 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THOP1P52888 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THOP1P52888 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THOP1P52888 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THOP1P52888 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THOP1P52888 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THOP1P52888 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THOP1P52888 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THOP1P52888 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THOP1P52888 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THOP1P52888 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THOP1P52888 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THOP1P52888 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THOP1P52888 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THOP1P52888 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
THOP1P52888 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THOP1P52888 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THOP1P52888 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THOP1P52888 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THOP1P52888 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THOP1P52888 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THOP1P52888 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THOP1P52888 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THOP1P52888 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THOP1P52888 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THOP1P52888 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THOP1P52888 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THOP1P52888 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THOP1P52888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THOP1P52888 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THOP1P52888 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THOP1P52888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THOP1P52888 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THOP1P52888 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THOP1P52888 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THOP1P52888 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THOP1P52888 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THOP1P52888 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THOP1P52888 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THOP1P52888 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THOP1P52888 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THOP1P52888 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THOP1P52888 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THOP1P52888 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THOP1P52888 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THOP1P52888 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THOP1P52888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THOP1P52888 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THOP1P52888 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THOP1P52888 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THOP1P52888 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THOP1P52888 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THOP1P52888 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THOP1P52888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THOP1P52888 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THOP1P52888 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THOP1P52888 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THOP1P52888 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THOP1P52888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THOP1P52888 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THOP1P52888 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THOP1P52888 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THOP1P52888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THOP1P52888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THOP1P52888 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THOP1P52888 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms